MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012529	GA	3	6	5	10	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012529	CGC	2	6	12	17	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012529	GCC	2	6	71	76	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012529	TGC	2	6	92	97	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012529	GAA	2	6	119	124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012529	TGGAA	2	10	173	182	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012529	CTG	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012529	CTG	2	6	203	208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012529	GT	3	6	2021	2026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012529	GGT	2	6	2072	2077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012529	GACG	2	8	2083	2090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012529	ATC	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012529	GAC	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012529	TCA	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012529	CTC	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_012529	CA	3	6	2418	2423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012529	TGA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012529	TG	4	8	2479	2486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012529	CAAC	2	8	2531	2538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012529	GCG	2	6	2620	2625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012529	CTTC	2	8	2639	2646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012529	CCA	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012529	TGG	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012529	AT	3	6	2841	2846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012529	GGA	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012529	GAG	2	6	2909	2914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012529	CTC	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_012529	CAC	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_012529	A	6	6	3051	3056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012529	CCT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012529	CTT	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012529	TGAT	2	8	3166	3173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012529	ATG	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012529	ATC	3	9	3199	3207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012529	AGA	2	6	3363	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012529	GTAT	2	8	3425	3432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012529	TAT	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012529	GAA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012529	GCG	2	6	3536	3541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012529	AGC	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012529	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012529	CTT	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012529	GTG	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012529	GGT	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012529	CTG	3	9	5431	5439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012529	GCTG	2	8	5452	5459	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012529	CGGGG	2	10	5482	5491	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012529	AGG	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012529	GGC	2	6	6683	6688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012529	GCC	2	6	6700	6705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012529	AGG	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012529	GAG	2	6	6782	6787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012529	AGTGA	2	10	14190	14199	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012529	GGC	2	6	14218	14223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012529	TCA	2	6	15492	15497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012529	CTG	2	6	15599	15604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012529	GCC	2	6	16051	16056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012529	AGG	2	6	16131	16136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012529	GC	3	6	16163	16168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012529	CGC	3	9	16166	16174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012529	CCTG	2	8	16204	16211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012529	CCTG	2	8	16233	16240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012529	GC	3	6	18012	18017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012529	TTC	2	6	18034	18039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012529	TGT	2	6	18053	18058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012529	TGCC	2	8	18073	18080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012529	CCT	2	6	18113	18118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012529	AGC	2	6	18157	18162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012529	AGG	3	9	19373	19381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012529	CTC	2	6	19394	19399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012529	T	6	6	19400	19405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012529	CCTG	2	8	22987	22994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012529	GCC	2	6	23051	23056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012529	GCA	2	6	23096	23101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012529	AGG	2	6	23102	23107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012529	CTG	2	6	23134	23139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012529	GCG	2	6	25693	25698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012529	GTCCG	2	10	28601	28610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012529	CCT	2	6	30148	30153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012529	GGTA	2	8	30157	30164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012529	TCA	2	6	31108	31113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012529	TG	3	6	32222	32227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012529	GGCT	2	8	32228	32235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012529	ATC	2	6	33140	33145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012529	CAG	2	6	33232	33237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012529	AG	3	6	33236	33241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012529	GCCT	2	8	33255	33262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012529	CT	3	6	33261	33266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012529	CTG	2	6	33284	33289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012529	GCG	2	6	34901	34906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012529	GGC	2	6	34914	34919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012529	TC	3	6	37108	37113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012529	TGG	2	6	37132	37137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012529	GC	3	6	37168	37173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012529	GCGG	2	8	37179	37186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012529	GCT	2	6	41955	41960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012529	CT	3	6	41959	41964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012529	CCA	2	6	42016	42021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_012529	TCTGG	2	10	42032	42041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012529	GCA	2	6	42085	42090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012529	CTG	2	6	42101	42106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012529	TC	3	6	42114	42119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012529	GT	3	6	43830	43835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012529	CTT	2	6	43898	43903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012529	TGCG	2	8	44419	44426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012529	CTGAC	2	10	44481	44490	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012529	TGC	2	6	47272	47277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012529	GCT	2	6	47313	47318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012529	GCT	2	6	47388	47393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012529	GAA	2	6	47469	47474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012529	AAC	2	6	47620	47625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012529	CGGG	2	8	47658	47665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012529	GCA	2	6	47669	47674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012529	CTG	2	6	47688	47693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012529	TTAA	2	8	47731	47738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012529	GCA	2	6	47795	47800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012529	CCTC	2	8	47868	47875	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_012529	AGG	2	6	47877	47882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012529	TGC	2	6	52204	52209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012529	CG	3	6	54167	54172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012529	CTG	2	6	54178	54183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012529	GCA	2	6	54989	54994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012529	AGC	2	6	55060	55065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012529	CCT	2	6	55079	55084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_012529	CCG	2	6	55089	55094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012529	GCG	2	6	55157	55162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012529	CGA	2	6	55211	55216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012529	GA	3	6	55218	55223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012529	TG	3	6	55241	55246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012529	TCC	2	6	55268	55273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_012529	GCC	2	6	56349	56354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012529	GCT	2	6	56360	56365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012529	CCA	2	6	56400	56405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_012529	GCG	2	6	56476	56481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012529	TGT	2	6	56571	56576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012529	CGA	2	6	56579	56584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012529	GCC	2	6	57848	57853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012529	CGG	2	6	57942	57947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012529	TCA	2	6	58040	58045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012529	AGCA	2	8	58364	58371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012529	TGGGTA	2	12	58416	58427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012529	GGT	2	6	59016	59021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012529	AGG	2	6	59042	59047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012529	CCG	2	6	59559	59564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_012529	AG	3	6	59720	59725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012529	GGT	2	6	59782	59787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012529	TGG	2	6	59818	59823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012529	GCG	2	6	59863	59868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_012529	TCAG	2	8	59877	59884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012529	CCG	2	6	59898	59903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_012529	CTG	2	6	59944	59949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_012529	AGG	2	6	59982	59987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012529	AGG	2	6	59989	59994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012529	AG	3	6	60006	60011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012529	GTC	2	6	60027	60032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_012529	CATC	2	8	60033	60040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_012529	GAC	2	6	60175	60180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_012529	TGG	2	6	62153	62158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012529	CACG	2	8	62181	62188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_012529	CTG	2	6	62202	62207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_012529	AGC	2	6	62229	62234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_012529	CGTT	2	8	62277	62284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_012529	TCC	2	6	62300	62305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_012529	CGCACC	2	12	62322	62333	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_012529	GGC	2	6	62374	62379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_012529	GCC	2	6	62385	62390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_012529	GA	3	6	62473	62478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012529	ACT	2	6	63236	63241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_012529	CAG	2	6	63324	63329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_012529	TTC	2	6	63340	63345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_012529	T	7	7	63371	63377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012529	GCA	2	6	63413	63418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_012529	GAG	2	6	63645	63650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012529	AG	3	6	63936	63941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012529	CT	3	6	63952	63957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_012529	TGT	2	6	63958	63963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012529	GTG	2	6	64076	64081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012529	GCG	2	6	64091	64096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_012529	C	6	6	64149	64154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
186	NC_012529	GGC	2	6	64175	64180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_012529	GCG	2	6	64251	64256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_012529	GTC	2	6	64311	64316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_012529	GT	3	6	87567	87572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_012529	ATTC	2	8	87580	87587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
275	NC_012529	GCA	2	6	88235	88240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_012529	GCC	3	9	89148	89156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_012529	TTCAGC	2	12	89227	89238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_012529	CTG	2	6	89248	89253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_012529	GAG	2	6	89301	89306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_012529	CGG	2	6	91731	91736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_012529	GCG	2	6	93641	93646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_012529	TCT	2	6	93658	93663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_012529	TCA	2	6	93681	93686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_012529	CAGCA	2	10	93891	93900	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_012529	ACCT	2	8	96433	96440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_012529	TG	3	6	96485	96490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_012529	TCGG	2	8	96587	96594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
292	NC_012529	GA	3	6	96597	96602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012529	CTG	2	6	96646	96651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_012529	GGC	2	6	96679	96684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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300	NC_012529	CTG	2	6	97043	97048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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332	NC_012529	CAT	2	6	106924	106929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_012529	TCG	2	6	137189	137194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_012529	GCT	2	6	141735	141740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_012529	T	6	6	141767	141772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_012529	GGT	2	6	154481	154486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_012529	CCAG	2	8	154599	154606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
462	NC_012529	CAAT	2	8	154610	154617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_012529	ATT	2	6	154823	154828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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